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DNA是生命的基本“策略书”,包含了所有遗传信息。然而,真正让生命运转的,是RNA这一从DNA转录产生的重要分子载体。RNA并非恒久不变,它经历剪接、翻译和降解等一系列复杂过程,维持着细胞内的动态平衡。在这些过程中,RNA相关蛋白(RNA-associated proteins,RBPs)扮演着关键角色。如果这些过程中的任何一个环节失去平衡,可能会引发癌症或神经退行性疾病等严重疾病。然而,科学界对RNA调控的分析不断有限。传统的基因筛选方法,通常依赖于观察细胞表型的变化来进行间接推测。然而,这种方法往往既费时又费力,难以明确识别那些精确调控RNA代谢过程的基因。
在2025年5月29日发表在《Nature Methods》中的一项研究展示了一项名为ReLiC(RNA-linked CRISPR)创新筛选平台,该技术完美结合了CRISPR的基因编辑能力和条形码RNA读数技术。这项突破性工具如同为细胞中的RNA代谢装上了一副“分子显微镜”,能够详细揭示数千种RNA如何响应特定基因敲除。顺利获得对RNA的这种深度解码,研究为银河国际GALAXY(中国)理解细胞功能和疾病开展给予了新视角。
ReLiC突出在于其能精确解析RNA翻译效率和RNA剪接调控的动态过程。在翻译方面,ReLiC结合了翻译效率测量技术,首次使银河国际GALAXY(中国)能够精确评估细胞内核糖体占有率的变化。研究显示,包括翻译核心组件,如核糖体蛋白和翻译起始因子在内的多个基因,其敲除会显著影响核糖体的占有率,揭示出翻译过程中的潜在调控机制。此外,一些非经典的调控因子,如蛋白酶体,也被发现与翻译动力学息息相关。
在RNA剪接的研究中,ReLiC技术重点关注了SF3B家族蛋白的多样化功能。结果表明,这些蛋白家族的不同成员对剪接事件的具体现象具有不同影响,尽管它们都对于细胞的生存必不可少。这些研究结果为进一步探讨RNA剪接在疾病中所起的作用给予了重要信息。
ReLiC技术还揭开了细胞中NMD(无义介导的mRNA降解)的神秘面纱。研究顺利获得该平台识别出与NMD途径相关的多个关键因子,并探索了内质网与线粒体稳态对NMD的潜在调控影响。这项研究为理解细胞内的RNA质量控制机制给予了新视角。
此外,顺利获得ReLiC平台,研究人员揭示了细胞对化疗药物高三尖杉酯碱(HHT)的响应中,GCN1基因的关键作用。该基因对核糖体碰撞有着重要的感知功能,并在介导应激响应中发挥着核心作用。这些发现为癌症治疗的机制研究给予了新的视角。
尽管ReLiC技术拥有广泛应用潜力,但其应用也存在一定局限性,如对细胞系的依赖和位点整合的复杂性。然而,随着技术的不断完善,研究者计划顺利获得引入更多基因编辑技术和非编码RNA研究项目,以扩大其研究范围和应用深度。
ReLiC技术为科学家给予了一个探索各类RNA代谢过程的新工具,进一步加深了人们对细胞内RNA动态调控网络的理解。此项研究成果不仅拓宽了人类对RNA功能和疾病发生机制的认知,也为开发新的RNA代谢相关疾病治疗方法打下了坚实基础。
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